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荧光定量PCR试剂盒-Taqman探针法

独特的PCR优化体系,使2× Real PCR EasyTM Mix-Taqman具有更强的兼容性。

热启动Foregene Taq Polymerase,具有更高的扩增效率、更高的扩增灵敏度、更高的扩增特异性。

2× Real PCR EasyTM Mix-Taqman使用Foregene优化的独特体系,提高sequence-specific probe检测的灵敏度和特异性。

本产品附带有ROX内参染料,可用于消除信号本底及孔间信号误差,方便客户用于不同型号定量PCR仪使用。

产 品 名 称

荧光定量PCR试剂盒-Taqman探针法

Real Time PCR EasyTM-Taqman

货    号

QP-01022

QP-01024

规    格

500 × 20 μL rxns

2000 × 20 μL rxns

价    格

1,213.00

4,138.00

描    述使用特异荧光探针进行Real Time PCR扩增反应,能大幅度提高产物特异性和反应灵敏度

产品介绍

Real Time PCR EasyTM-Taqman试剂盒提供的2× Real PCR EasyTM Mix-Taqman是一种使用特异荧光探针进行Real Time PCR扩增反应的全新预混系统,能大幅度提高产物特异性和反应灵敏度。同时,提供ROX作为内参染料。该Real Time PCR Mix扩增效率高,能更灵敏的、更直观的反应目的模板DNA的浓度。

2× Real PCR EasyTM Mix-Taqman包含本公司特有的热启动ForegeneTaq DNA Polymerase,该酶相对于普通Taq酶具有扩增效率高、特异性扩增能力强、错配率低等优点。用于荧光定量PCR反应可减少非特异性扩增,提高PCR的准确性。


试剂盒应用

荧光定量PCR进行模板定量分析/常规PCR扩增/可用于等位基因的检测。


储存条件

本试剂盒避光保存于-20°C;若频繁使用,也可置于4°C短期保存(10天内用完)

试剂盒内容

2× Real PCR EasyTM Mix-Taqman:包含福际生物特别改造的热启动Taq DNA PolymeraseMgCl2、优化配比的dNTPs、反应缓冲液、PCR反应增强剂、优化剂以及稳定剂等。PCR反应时,只需将适当的裂解混合液、引物、DNase-ddH2O添加到2× Real PCR EasyTM Mix-Taqman中即可用于PCR反应。

ROX Reference Dye:一般用于ABIStratagene等公司的Real Time PCR扩增仪上,用于调整PCR加样误差所引起的 PCR管与管之间的差异。不同仪器所需ROX Reference Dye浓度不同,用户可以根据仪器的推荐浓度添加。

DNase-Free ddH2O:超纯水,用于PCR反应。


试剂盒原理

PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。再通过实时监测整个PCR进程荧光信号的积累,与标准曲线对比进行定量分析。

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Real Time PCR引物设计原则

Forward PrimerReverse Primer

进行Real TimePCR,引物设计非常重要。引物关系到PCR扩增的特异性、高效性等,可以参照以下原则进行引物设计:

u  引物长度:18-30bp

u  GC含量:40-60%

u  Tm值:引物设计软件,如Primer 5,可以给出引物的Tm值。上下游引物的Tm值应    尽量接近。也可以使用Tm计算公式:Tm=4(G+C)+2(A+T)。进行PCR时,一般选择低于引物Tm5的温度作为退火温度(相应的提高退火温度可以增加PCR反应的特异性)。

u  引物及PCR产物:

v  设计引物PCR扩增产物长度最好在100-150bp

v  应尽量避开在模板的二级结构区域设计引物。

v  避免上下游引物3’端之间形成2个或2个以上的互补碱基。

v  引物3’端碱基不能存在多余3个连续的GC

v  引物自身不能存在互补结构,否则会形成发夹结构,影响PCR扩增。

v  引物序列中ATCG应尽量分布均匀,3’端碱基避免为T

Probe

探针选择要保守,引物选择要保守,因此必须找一段100-200bp相对要保守的片段来设计引物与探针。即real-time PCR的扩增片段是50bp-150bp。当找不到150bp的保守片段时,必须确保探针的片段是保守的。一般按照以下原则进行Probe的设计:

u  探针位置尽可能地靠近上游引物。

u  探针长度应在15-45bp(最好是20-30bp),以保证结合特异性。

u  检测探针的DNA折叠和二级结构。

u  Tm值在65-70,通常比引物TM值高5-10(至少要5)GC含量在40%-70%

u  探针的5’端应避免使用G鸟嘌呤——因为5’G会有淬灭作用,而且即使是被切割下来还会存在淬灭作用。

u  整条探针中,碱基C的含量要明显高于G的含量——G含量高会降低反应效率,这时就应选择配对的另一条链作为探针。

u  为确保引物探针的特异性,最好将设计好的序列在blast中核实一次,如果发现有非特异性互补区,建议重新设计引物探针。

  • 无扩增信号

    Answer

    1.    试剂盒中的TaqDNA Polymerase因试剂盒保存不当或过期而失去活性。

    建议:确认试剂盒的保存条件;重新在PCR体系中添加适量Taq DNA Polymerase或者购买新的Real Time PCR Kit试剂盒进行相关实验。

    2.    DNA模板中存在大量的Taq DNA Polymerase的抑制因子。

    建议:重新纯化模板或降低模板的使用量。

    3.    Mg2+浓度不适合。

    建议:我们提供的2× Real PCR MixMg2+浓度为3.5 mM。但针对有些特殊的引物和模板可能需要的Mg2+浓度较高,因此可直接添加MgCl2进行Mg2+浓度的优化,建议每次增加0.5mMMg2+进行优化。

    4.    PCR扩增条件不适合、引物序列或者浓度不当。

    建议:确认引物序列的正确性以及引物没有降解;扩增信号不好时,可尝试降低退火温度,适当调整引物浓度等。

    5.    模板用量问题,太少或过多。

    建议:可进行模板线性化梯度稀释,选择PCR效果最好的模板浓度进行Real Time PCR实验。


  • NTC出现过高的荧光值

    Answer

    1.    在操作过程中导致的试剂污染。

    建议:更换新的试剂进行Real Time PCR实验。

    2.    PCR反应体系配制时发生污染。

    建议:操作时进行必要的防护措施,比如:戴乳胶手套,使用带滤芯的枪头等。

    3.    引物出现降解,引物降解会导致非特异性扩增出现。

    建议:可使用SDS-PAGE电泳检测引物是否降解,更换新的引物进行Real Time PCR实验。


  • 出现引物二聚体或非特异性扩增

    Answer

    1.    Mg2+浓度不适合。

    建议:我们提供的2× Real PCR EasyTM MixMg2+浓度为3.5 mM。但针对有些特殊的引物和模板可能需要的Mg2+浓度较高,因此可直接添加MgCl2进行Mg2+浓度的优化,建议每次增加0.5mMMg2+进行优化。

    2.    PCR退火温度过低。

    建议:每次增加1或者2进行PCR退火温度的优化。

    3.    PCR产物太长。

    建议:Real Time PCR产物长度最好在100-150bp之间,不要超过500bp

    4.    引物出现降解,引物降解会导致非特异性扩增出现。

    建议:可使用SDS-PAGE电泳检测引物是否降解,更换新的引物进行Real Time PCR实验。

    5.    PCR体系不当,或体系太小。

    建议:PCR反应体系太小会导致检测精度降低。最好使用定量PCR仪推荐的反应体系重新进行Real Time PCR实验。


  • 定量值重复性差

    Answer

    1.    仪器故障。

    建议:仪器的每一个PCR孔之间可能存在误差,在温度管理或检测时产生重现性较差现象。请根据相应仪器的说明书进行点检。

    2.    样品纯度不好。

    建议:样品不纯会导致实验的重复性较差,这包括模板、引物的纯度。最好进行模板的再纯化,引物最好使用SDS-PAGE纯化。

    3.    PCR体系配制放置时间过长。

    建议:Real Time PCR体系配制好后立即用于PCR实验,不要搁置太长时间。

    4.    PCR扩增条件不适合、引物序列或者浓度不当。

    建议:确认引物序列的正确性以及引物没有降解;扩增信号不好时,可尝试降低退火温度,适当调整引物浓度等。

    5.    PCR体系不当,或体系太小。

    建议:PCR反应体系太小会导致检测精度降低。最好使用定量PCR仪推荐的反应体系重新进行Real Time PCR实验。


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