产 品 名 称 | 植物基因组DNA提取试剂盒 Plant DNA Isolation Kit |
货 号 | DE-06111 |
规 格 | 50T |
价 格 | ¥436.00 |
描 述 | 快速从植物样本(包括多糖多酚植物样本)中纯化获得高质量的基因组DNA。 |
产品介绍
本试剂盒采用可以特异性结合DNA的DNA-Only Column、全新的Foregene Protease以及独特的缓冲体系,大大简化了植物基因组DNA提取步骤,在30分钟内可获得高纯度基因组DNA,极大程度上避免了基因组DNA的降解。
离心柱中的DNA-Only硅胶膜可高效、特异吸附DNA,无需添加任何有机试剂即可最大限度的去除RNA、杂质蛋白、离子及多糖、多酚等有机化合物。获得的DNA片段大,纯度高、质量稳定可靠。
试剂盒应用
该试剂盒适用于新鲜或冻存的植物组织基因组DNA提取纯化。
纯化DNA的应用
植物基因组DNA提取试剂盒纯化获得的基因组DNA纯度高,可用于常规分子生物学操作,如:酶切、PCR、Southern杂交、文库构建等实验。
DNA提取得率和纯度
提取获得的植物基因组DNA量与植物样本的来源、样本的新鲜程度、保存条件、水分含量等因素相关。使用PlantDNA Isolation Kit处理各种来源植物新鲜叶片样本,获得的基因组DNA量和纯度见下表:
新鲜幼嫩叶片 | 样本用量(mg) | DNA产量(μg) | OD260/280 |
玉米 | 100 | 4-7 | 1.7-1.9 |
大豆 | 100 | 5-7 | 1.7-1.9 |
小麦 | 100 | 10-14 | 1.7-1.9 |
棉花 | 100 | 3-5 | 1.7-1.9 |
水稻 | 100 | 4-6 | 1.7-1.9 |
烟草 | 100 | 5-7 | 1.7-1.9 |
油菜 | 100 | 2-3 | 1.7-1.9 |
注意:此表数据仅作参考,实际操作中由于所用材料的存储条件、操作熟练度等因素影响,所得数据会与此表数据有些许出入。
试剂盒内容
Buffer PL1:提供植物组织裂解环境。
Foregene Protease:在Buffer PL1的环境下酶解植物组织中的蛋白质。
Buffer PL2:失活Foregene Protease,并提供DNA上柱环境。
Buffer PW:去除DNA中的蛋白质、RNA等杂质。
Buffer WB:去除DNA中的残留的盐离子。
Buffer EB:洗脱纯化柱膜上的DNA。
DNA-only Column:特异吸附裂解产物中的基因组DNA。
产品信息
型号 | 离心柱型 | 纯化组件 | Foregene离心柱、试剂 |
通量 | 1-24个样品 | 制备时间 | ~30 min (24个样品) |
离心机 | 台式离心机 | 样本酶解物分离 | 离心分离 |
离心柱液体盛装量 | 800 μL | 纯化柱DNA承载量 | 80 μg |
洗脱体积 | 100-200 μL | 植物样本处理量 | 100 mg |
操作流程
说明书
产品文献
A simple and cost-effective method for screening of CRISPR/Cas9-induced homozygous/biallelic mutants
Jinggong Guo, Kun Li, Lifeng Jin, Rui Xu, Kaiting Miao, Fengbo Yang,Chaoya Qi, Lin Zhang, Jose R.Botella, Ran Wang, Yuchen Miao
河南大学植物胁迫生物学研究所生物系棉花生物学国家重点实验室
Plant Methods ( IF 4.269 ) Pub Date : 2018-05-29, DOI:10.1186/s13007-018-0305-8
文章链接:https://plantmethods.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13007-018-0305-8
DNA barcoding analysis and phylogenetic relationships of tree species in tropical cloud forests
Yong Kang, Zhiyan Deng, Runguo Zang & Wenxing Long
海南热带生物资源可持续利用重点实验室Scientific Reports ( IF 4.259 ) Pub Date : 2017-10-02, DOI:10.1038/s41598-017-13057-0
文章链接:https://www.nature.com/articles/s41598-017-13057-0
Complete Chloroplast Genome Sequence of Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg and Evolution Analysis within the Malvales Order
Ying Wang, Di-Feng Zhan, Xian Jia, Wen-Li Mei, Hao-Fu Dai, Xiong-Ting Chen* and Shi-Qing Peng
中国热带农业科学院热带生物科学与生物技术研究所
农业部热带作物生物学与遗传资源重点实验室
Frontiers in Plant Science ( IF 4.495 ) Pub Date : 2016-03-08, DOI:10.3389/fpls.2016.00280
文章链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4781844/
MSDS
COA
提取过程中无法获得基因组DNA
Answer
通常有多种因素会影响基因组DNA产量,包括样本来源、样本新老程度、样本保存条件、操作等。
1. 组织样本保存不当或保存时间太长,导致基因组DNA已经降解。
建议:组织样本保存于液氮或者-20℃;尽量使用新近采集样本进行基因组DNA的提取。
2. 样本用量过少可能导致提取不到相应的基因组DNA。
建议:对于保存时间很长或基因组DNA降解比较厉害的组织样本,可以适当增加组织样本的用量,以便提取获得可观的基因组DNA。可以根据DNA需要确定样本的用量,但是新鲜样本不宜超过100mg,干燥样本不宜超过30mg。
3. 样本没有进行液氮研磨或液氮之后放置时间过长。
建议:在进行DNA提取时,样本需进行液氮充分研磨以破碎细胞壁;研磨完成后请尽快将样本粉末转移至65℃预热的Buffer PL1中(一旦研磨的粉末融化,基因组DNA便开始快速降解)。
4. Foregene Protease保存不当,导致其活性降低或失活。
建议:确认Foregene Protease保存条件或者更换新的Foregene Protease进行酶解反应。
5. 试剂盒保存不当或存放时间太长,导致试剂盒里面某些组分失效。
建议:购置新的植物基因组DNA提取试剂盒进行相关操作。
6. 试剂盒使用不当。
建议:购置样本专用的植物基因组DNA提取试剂盒(Plant DNA Isolation Kit)进行植物基因组DNA的提取纯化。
7. Buffer WB没有添加无水乙醇。
建议:确认Buffer WB中添加正确体积的无水乙醇。
8. 洗脱液没有正确滴加到硅胶膜上。
建议:将65℃预热的洗脱液滴加到硅胶膜的正中间,并在室温放置5分钟增加洗脱效率。
提取获得低产量基因组DNA
Answer
1. 样本保存不当或保存时间太长,导致基因组DNA降解。
建议:组织样本保存于-20℃;尽量使用新近采集组织样本进行基因组DNA的提取。
2. 组织样本用量过少,提取到的基因组DNA含量会较少。
建议:有些植物样本含水量丰富,比如:水生植物如藻类等,可以适当增加其用量或将其稍微失水后再进行操作。
3. 样本液氮研磨不彻底或者研磨完成后在室温放置时间过长。
建议:液氮研磨一定要充分,尽量破碎样本细胞壁;研磨完成后立即将样本粉末转移至65℃预热的Buffer PL1中进行下一步操作。
4. 没有使用正确的试剂盒。
建议:使用专用的植物基因组DNA提取试剂盒(Plant DNA Isolation Kit)进行植物基因组DNA的提取纯化。
5. ForegeneProtease保存不当,导致其活性降低或失活。
建议:确认Foregene Protease保存条件或者更换新的Foregene Protease进行酶解反应。
6. 洗脱液问题
建议:请使用Buffer EB进行洗脱;如果使用ddH2O或其他洗脱液,确认洗脱液的pH值在7.0-8.5之间。
7. 洗脱液没有正确滴加
建议:请将洗脱液滴加到硅胶膜的正中间,并在室温放置5分钟增加洗脱效率。
8. 洗脱液体积太少
建议:请按说明书上要求使用洗脱液进行基因组DNA洗脱,最少不要低于100μL。
提取获得基因组DNA纯度低
Answer
基因组DNA纯度低会导致下游实验的失败或效果差,如:酶切不开,PCR得不到目的基因片段等。
1. 杂蛋白污染、RNA污染。
分析:没有使用Buffer PW洗涤纯化柱;Buffer PW洗涤纯化柱没有使用正确的离心转速。
建议:在上清液过柱时尽量保证上清液中无沉淀;务必按说明书进行Buffer PW洗涤纯化柱,并且此步骤不能省略。
2. 杂质离子污染。
分析:省略了Buffer WB洗涤纯化柱或者只洗涤了一次,导致残留的离子污染。
建议:务必按说明书使用Buffer WB洗涤2次,以尽量去除残留的离子。
3. RNA酶污染。
分析:Buffer中添加了外源的RNA酶;Buffer PW洗涤操作不正确,导致RNA酶残留,影响下游RNA实验操作,如:体外转录等。
建议:Foregene系列核酸提取试剂盒无需额外添加RNA酶即可去除RNA,Plant DNA Isolation Kit里面所有试剂均无需添加RNA酶;务必按说明书进行Buffer PW洗涤纯化柱,并且此步骤不能省略。
4. 乙醇残留。
分析:Buffer WB洗涤纯化柱后,没有进行空管离心操作。
建议:按说明书进行正确的空管离心操作。